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返回理想的组织培养实验室应该建立在安静、清洁、远离污染源的地方，好在常年主风向的上风方向，尽量减少污染。规模化生产的组织培养实验室好建在交通方便的地方，便于培养产品的运送。
实验室的建设均需考虑两个方面的问题：一是所从事的实验的性质，即是生产性的还是研究性的，是基本层次的还是较高层次的；二是实验室的规模，规模主要取决于经费和实验性质。无论实验室的性质和规模如何，实验室设置的基本原则是：科学、经济和实用。一个组织培养实验室必须满足3个基本的需要：实验准备（培养基制备、器皿洗涤、培养基和培养器皿灭菌）、无菌操作和控制培养。此外，还可根据从事的实验要求来考虑辅助实验室及其各种附加设施，使实验室更加完善。
在进行植物组织培养工作之前，应对工作中需要哪些基本的设备条件有个全面的了解，以便因地制宜地利用现有房屋，或新建、改建实验室。实验室的大小取决于工作的目的和规模。以工厂化生产为目的，实验室规模太小，则会限制生产，影响效率。在设计组织培养实验室时，应按组织培养程序来设计，避免某些环节倒排，引起日后工作混乱。植物组织培养是在严格无菌的条件下进行的。要做到无菌的条件，需要一定的设备、器材和用具，同时还需要人工控制温度、光照、湿度等培养条件。
接种室宜小不宜大，一般10~20m2即可。要求封闭性好，干爽安静，清洁明亮，能较长时间保持无菌，因此不宜设在容易受潮的地方；地面、天花板及四壁尽可能密闭光滑，易于清洁和消毒；配置拉动门，以减少开关门时的空气扰动；为便于消毒处理，地面及内墙壁都应采用防水和耐腐蚀材料；为了保持清洁，无菌室应防止空气对流。接种室要求在适当位置吊装 1~2盏紫外线灭菌灯，用以照射灭菌。好安装一小型空调，使室温可控，这样可使门窗紧闭，减少与外界空气对流。
进入无菌室前的一个缓冲场地，减少人体从外界带入的尘埃等污染物。工作人员在此换上工作服、拖鞋，戴上口罩，才能进入无菌室和培养室。进入无菌操作室前在此更衣换鞋，以减少进出时带入接种室杂菌。
