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新建组培室最好选择在空气清新、光线充足、通风良好、环境清洁、水电齐备、交通便利的地方，避开各种污染源，以利于组织培养的顺利进行，降低培养过程的污染率，培育出优质试管苗。也可因地制宜地利用现有房舍，按照组培室的要求改造成组培室，做到因陋就简，既能开展研究和生产工作，有不花费过多。
植物组织培养实验室的大小可根据各自的工作性质和生产规模来设计，面积可大可小，主要用于科研和小规模生产的，面积较小；进行大规模工厂化生产的，面积较大，也常称为“组培工厂”。不论是实验室还是组培工厂，其建造要求、结构和功能基本相同，只是规模大小不同而已。
一个大型的组培室可设置洗涤室、药品室、称量室、培养基配制室、灭菌室、接种室、培养室、观察记录室、储藏室等，另外在室外还配有一定面积移苗温室。小型组培室可在同类中加以合并，如洗涤室、培养基配制室、灭菌室合并为一个准备室，药品室、称量室、观察记录室合并为一个综合实验室。但是接种室、培养室和移苗室都需要单独设置。
组培室布局要合理，通常按组织培养的工作程序，安排成一条连续的生产线，避免因有的环节倒排，而增加以后工作的负担或引起混乱。设计时要做到工作方便，减少污染，节省能源，应设有消防设施，安全使用。
